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美國(guó)人類遺傳學(xué)雜志的最新研究——兒童心肌病的遺傳結(jié)構(gòu)
發(fā)布時(shí)間:2022-01-26 19:00:00來(lái)源:
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近日,《The American Journal of Human Genetics》期刊上發(fā)表了題為“The genetic architecture of pediatric cardiomyopathy”的文章。為了了解原發(fā)性兒童心肌病的遺傳因素,研究人員對(duì)528名心肌病兒童進(jìn)行了外顯子組測(cè)序,在32%的受累個(gè)體中確定了遺傳原因。因此,確定了有關(guān)兒童心肌病遺傳結(jié)構(gòu)的重要信息,并支持兒童臨床基因檢測(cè)的建議,同時(shí)說(shuō)明了年齡、血統(tǒng)和亞表型在遺傳結(jié)構(gòu)上的差異,并為調(diào)查多基因貢獻(xiàn)的大型研究提供了理論依據(jù)。


圖解摘要


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摘要


為了了解原發(fā)性兒童心肌病的遺傳因素,研究人員對(duì)528名心肌病兒童進(jìn)行了外顯子組測(cè)序。利用臨床解釋指南和與心肌病相關(guān)的靶向基因,在32%的受累個(gè)體中確定了遺傳原因。心肌病亞表型因血統(tǒng)、診斷年齡和家族史而不同。小于1歲的嬰兒不太可能有分子診斷(p<0.001)。通過(guò)使用一組1703個(gè)候選基因和信息學(xué)工具,在56%的受累個(gè)體中發(fā)現(xiàn)了罕見(jiàn)和有害的變異。與兩個(gè)獨(dú)立的對(duì)照組,即千人基因組計(jì)劃(p<0.001)和SPARK親本對(duì)照組(p<1×10-16)相比,研究人員發(fā)現(xiàn)受累個(gè)體的有害變異負(fù)荷顯著。當(dāng)按血統(tǒng)、變異類型和亞表型進(jìn)行分層時(shí),心肌病變異負(fù)荷仍顯著,強(qiáng)調(diào)了理解這些因素對(duì)遺傳結(jié)構(gòu)貢獻(xiàn)的重要性。這一發(fā)現(xiàn)中候選基因的富集表明心肌病亞表型特異性病因和表現(xiàn)形式的多基因機(jī)制。這些結(jié)果確定了有關(guān)兒童心肌病遺傳結(jié)構(gòu)的重要信息,并支持兒童臨床基因檢測(cè)的建議,同時(shí)說(shuō)明了年齡、血統(tǒng)和亞表型在遺傳結(jié)構(gòu)上的差異,并為調(diào)查多基因貢獻(xiàn)的大型研究提供了理論依據(jù)。


結(jié)果


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圖1. 外顯子組測(cè)序的診斷率


注:(A-C)對(duì)37個(gè)已知心肌病相關(guān)基因的外顯子組數(shù)據(jù)進(jìn)行篩選,并根據(jù)臨床指南對(duì)變異進(jìn)行分類,以確定致病或可能致病變異,這些變異的存在被認(rèn)為是陽(yáng)性結(jié)果。

(A)總診斷率。(B)按血統(tǒng)劃分的診斷率。(C)按心肌病亞型劃分的1歲以下嬰兒(灰色條)和較大兒童(黑色條)的診斷率。每個(gè)年齡組的參與人數(shù)顯示在每條下方。

DCM,擴(kuò)張型心肌?。籋CM,肥厚型心肌??;LVNC,左室致密化不全;PCM,兒童心肌??;RCM,限制型心肌病。


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圖2. 心臟發(fā)現(xiàn)基因的變異負(fù)荷分析顯示,兒童心肌病隊(duì)列中的變異負(fù)荷富集


注:(A)變異負(fù)荷,以具有有害變異的樣本的百分比表示,按表型劃分,包括共識(shí)、ClinVar、不耐受和組合基因集。百分比顯示在每條的上方,個(gè)體數(shù)量顯示在x軸的括號(hào)中。

(B)按血統(tǒng)和表型劃分的共識(shí)、ClinVar、不耐受和組合基因集的變異負(fù)荷。PCM參與者與千人基因組(1000G)數(shù)據(jù)進(jìn)行比較。

Combined,出現(xiàn)在共識(shí)、ClinVar、錯(cuò)義不耐受或功能缺失不耐受的基因列表中的基因。

DCM,擴(kuò)張型心肌病;HCM,肥厚型心肌?。籐oF,功能缺失;LVNC,左室致密化不全;PCM,兒童心肌?。籖CM,限制型心肌病。

*兒童心肌病和千人基因組(1000G)之間負(fù)荷存在顯著差異(p<0.001)。


結(jié)論:


總之,這項(xiàng)針對(duì)北美原發(fā)性PCM兒童的多位點(diǎn)研究表明,雖然從原發(fā)性成人心肌病遺傳學(xué)研究中確定的基因具有臨床價(jià)值,但仍有改進(jìn)的空間。具體而言,該研究結(jié)果表明,擴(kuò)大包括嬰兒和非歐洲血統(tǒng)個(gè)體在內(nèi)的更多樣化的研究人群,將對(duì)提高診斷性基因檢測(cè)的診斷率至關(guān)重要。此外,罕見(jiàn)的有害變異負(fù)荷的增加表明需要考慮額外的基因以及多基因遺傳模型。研究人員期望這一龐大的兒科隊(duì)列將為兒科醫(yī)生提供所需的證據(jù),以支持廣泛的臨床基因檢測(cè)和研究人員檢驗(yàn)新基因貢獻(xiàn)的機(jī)會(huì)。


參考文獻(xiàn)

Ware SM, Bhatnagar S, Dexheimer PJ, et al. The genetic architecture of pediatric cardiomyopathy. Am J Hum Genet. 2022 Jan 10: S0002-9297(21)00461-4.


關(guān)于心肌病及相關(guān)內(nèi)容的更多介紹如下:

《與擴(kuò)張型心肌病相關(guān)的致病變異預(yù)測(cè)兒童心肌炎的預(yù)后》

《成人擴(kuò)張型心肌病的遺傳學(xué)》

《2021 AHA科學(xué)聲明:兒童遺傳性心血管病基因檢測(cè)》

《兒童期與成人期肥厚型心肌病的臨床特點(diǎn)及預(yù)后差異》

《Circulation:擴(kuò)張型心肌病相關(guān)基因的循證評(píng)估》

《AHA/ACC肥厚型心肌病的診斷和治療指南2020年更新》


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